マルチオミクス情報ネットワーク解析を用いた植物細胞壁脱構築における比較マイクロバイオーム性能の評価【JST・京大機械翻訳】

Tom, L. M.; Aulitto, M.; Wu, Y.-W.; Gao, Y. W.; Deng, K.; Xiao, N.; Rodriguez, B. G.; Louime, C.; Northen, T. R.; Eudes, A.; Mortimer, J.; Adams, P. D.; Scheller, H.; Simmons, B. A.; Ceja-Navarro, J.; Singer, S. W.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202211412111562 整理番号：22P0031990

マルチオミクス情報ネットワーク解析を用いた植物細胞壁脱構築における比較マイクロバイオーム性能の評価【JST・京大機械翻訳】

Assessing Comparative Microbiome Performance in Plant Cell Wall Deconstruction Using Multi-omics-Informed Network Analysis

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著者 (16件)： , , , , , , , , , , , , , , ,
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発行年： 2022年01月10日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月10日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

植物の細胞壁は,分解に不応性の織り構造である。天然および適応ミクロビオームは,特に植物細胞壁解体において有効である。これらの破壊的ミクロビオームの研究は,ミクロビオーム性能を評価し,それを特定の微生物個体群および酵素に関連づける機会を提供する。比較ミクロビオーム性能を評価するシステムを確立するために,平行ミクロビオームを堆肥接種物からモロコシ(Sorghum bicolor L.Moench)で培養した。バイオマス損失と生化学分析は,これらのミクロビオームがバイオマスを解体する能力で発散することを示した。時間依存遺伝子発現からのネットワーク再構成は,Actinotalea,Filomicrobium,およびGemanimonadetes個体群を含む適応モロコシ分解コミュニティ内の重要な破壊群を同定した。遺伝子発現の機能分析は,微生物が植物細胞壁ポリマーを解体する酵素にリンクする遷移段階を通して進行することを示した。このネットワークと機能分析の組合せは,これらのミクロビオームの性能を区別する際のセルロース活性Actinobacteriaの重要性を強調した。【JST・京大機械翻訳】

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異種生物間相互作用 , 遺伝学研究法 , 微生物の生態 , 微生物学(ウイルス以外)一般 , 分子遺伝学一般

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