マウス白血病細胞および組織におけるMHCクラスIおよびII発現の臓器全体マッピング【JST・京大機械翻訳】

Guethlein, L. A.; Ezran, C. S.; Liu, S.; Krasnow, M. A.; Parham, P.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202211415739660 整理番号：22P0316711

マウス白血病細胞および組織におけるMHCクラスIおよびII発現の臓器全体マッピング【JST・京大機械翻訳】

Organism-wide mapping of MHC class I and II expression in mouse lemur cells and tissues

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発行年： 2022年03月02日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月02日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

主な組織適合性複合体(MHC)クラスIおよびII糖蛋白質は,多くの疾患表現型,機構および結果と関係する。これらの関連は,アロタイプ多型またはアロタイプ発現の変化レベルに起因する可能性がある。細胞型と微小環境の範囲においてよく研究されているが,個々のマウス白血病に存在する全ての細胞型を包含していない。本研究では,マウスlemur細胞アトラス(Tabula Microcebus)からの液滴ベースの単一細胞RNA配列データを用いて,MHCクラスIとII発現のパターンを調べた。細胞アトラスは,4匹のマウス白血病から27の器官から得られたデータを含み,両方の細胞型と個々の白血病の間の発現パターンの比較を可能にする。遺伝子発現のパターンは,4匹のマウス白血病の間で良い一致を示した。発現の3つの一次パターンを同定し,異なる細胞型と関連させた。細胞発生と空間勾配の既存の細胞軌跡へのMHC発現マッピングは,単一組織における発現レベルとパターンにおける微細なスケール差を明らかにした。ここで開発した生物情報学パイプラインは,他の細胞アトラスプロジェクトに適用可能である。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , 【Automatic Indexing@JST】

免疫反応一般 , 腫ようの免疫療法 , 抗原・抗体・補体一般 , 遺伝子操作

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