復帰と未分化細胞の間の近接分子近接の証拠【JST・京大機械翻訳】

Zreika, S.; Fourneaux, C.; Vallin, E.; Modolo, L.; Seraphin, R.; Moussy, A.; Ventre, E.; Bouvier, M.; Ozier-Lafontaine, A.; Bonnaffoux, A.; Picard, F.; Gandrillon, O.; Gonin-Giraud, S.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202211501662785 整理番号：22P0314049

復帰と未分化細胞の間の近接分子近接の証拠【JST・京大機械翻訳】

Evidence for close molecular proximity between reverting and undifferentiated cells

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資料名：
発行年： 2022年02月03日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年02月03日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

Waddingtonsエピジェネティクス景観概念に従って,分化過程は,丘陵(増殖状態)の頂部からのボール回転と,その安定分化状態に達するための盆地または「アトラクタ状態」の停止前の交差溝に,細胞アキンによって例証できる。しかし,いくつかのコミットした細胞は,より多能性な細胞状態のある程度の可塑性と再獲得表現型特性を保持することができることが明らかである。この動的モデルと一致して,著者らは以前に,分化する細胞(ニワトリ赤血球前駆細胞(T2EC))が自己再生条件で戻されたときに自己再生する能力を24時間保持することを示した。これらの興味と有望な結果にもかかわらず,それらの「復帰」細胞の根底にある分子状態は未調査のままである。したがって,本研究の目的は,単一細胞トランスクリプトームデータの大部分を作るために,高度な統計的ツールを結合することにより,T2EC復帰プロセスを分子的に特性化することであった。この目的のために,自己再生培地(0H)で最初に維持されたT2ECを24時間(24H分化細胞)の分化に誘導した。次に,これらの細胞の一部は自己再生培地(48H復帰細胞)に戻され,他の部分は別の24時間(48H分化細胞)の分化培地に維持された。各時点で,細胞トランスクリプトームをscRT-qPCRとscRNAseqを用いて作成した。著者らの結果は,次元縮小を適用するとき,0Hと48H復帰セルの間の強い重複を示した。さらに,細胞分布と差次的発現解析の統計的比較は,これらの2つの細胞群の間で有意差を示さなかった。興味深いことに,遺伝子パターン分布により,48H復帰細胞は0H細胞とより類似した遺伝子発現パターンを持つが,それらは分化過程においてそれらの関与の痕跡を保持することを明らかにした。最後に,Sparse PLS分析は,3つの遺伝子の発現だけが48H復帰と0H細胞を識別することを示した。まとめると,復帰細胞は未分化細胞とほぼ同一の初期分子状態に戻ることを示し,分化過程中の以前には報告されていない生理学的および分子可塑性を示し,それはおそらく基礎となる分子ネットワークの動的挙動から生じる。【JST・京大機械翻訳】

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発生と分化 , 細胞生理一般

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