エピスタティック配列景観による61,157大腸菌ゲノムの多型解読【JST・京大機械翻訳】

Vigue, L.; Croce, G.; Petitjean, M.; Ruppe, E.; Tenaillon, O.; Weigt, M.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202211599803756 整理番号：22P0312991

エピスタティック配列景観による61,157大腸菌ゲノムの多型解読【JST・京大機械翻訳】

Deciphering polymorphism in 61,157 Escherichia coli genomes via epistatic sequence landscapes

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発行年： 2022年01月23日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月23日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

変異の影響の特性化は,蛋白質配列の進化を理解し,有害なものから中性アミノ酸変化を分離するために重要である。残基間の上位相互作用は突然変異効果の文脈依存性をもたらす。文脈依存性は,短期の多型に寄与するアミノ酸変化を制約し,長期に種間を蓄積できる。遠隔同族体の分析から61,157の大腸菌ゲノムのパネルにおける多型分離を正確に予測するための計算アプローチを用いた。非エピスタティックアプローチに対するコンテキストアウェアド直接結合解析モデリングを比較することにより,遺伝的文脈がアミノ酸部位の30%から50%の許容アミノ酸を強く制約することを示した。より遠い種の研究は,小さな上位性の寄与の蓄積による長い進化時間スケールにわたる遺伝的状況の漸進的な構築を示唆する。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , 【Automatic Indexing@JST】

進化論一般 , 遺伝的変異

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