拘束に基づくモデリングは上皮から間葉への移行時の代謝脆弱性を同定する【JST・京大機械翻訳】

Campit, S. E.; Keshamouni, V. G.; Chandrasekaran, S.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202211666669482 整理番号：22P0313930

拘束に基づくモデリングは上皮から間葉への移行時の代謝脆弱性を同定する【JST・京大機械翻訳】

Constraint-based modeling identifies metabolic vulnerabilities during the epithelial to mesenchymal transition

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発行年： 2022年02月03日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年02月03日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

上皮間葉転換(EMT)は,腫瘍転移に重要な発達的に保存された細胞過程である。EMTは,悪性上皮細胞を間葉様移動および浸潤表現型を獲得することを可能にする。EMT癌細胞では,増殖の抑制とエネルギー集約的移動挙動の刺激と相関する広範な代謝リプログラミングを受ける。しかし,EMTの間に起こる代謝変化と協調生理学的表現型の間の因果関係はまだ不明である。制約に基づくモデリングを用いて代謝ネットワーク活性をシミュレートするために,A549肺腺癌細胞における5つの独立したEMT研究から,バルクの経時変化トランスクリプトミクスとプロテオミクスと単一細胞トランスクリプトミクスを用いた。モデル予測を,文献マイニング,実験的研究およびCRISPR-Cas9の必須スクリーンを用いて検証した。解糖およびグルタミン代謝反応における時間的代謝依存性を明らかにし,EMT時の細胞生存に対するEnolase3に対するイソ型特異的依存性を実験的に検証した。まとめると,著者らのアプローチは,EMTを受ける細胞における時間的に制御された細胞状態特異的代謝依存性を明らかにした。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , , 【Automatic Indexing@JST】

腫ようの化学・生化学・病理学 , 細胞生理一般

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