プレプリント
J-GLOBAL ID:202202211928681039   整理番号:22P0321509

統合的ゲノミクス解析は頭蓋内動脈瘤破裂のリスクの基礎となるFGD6発現の減少を意味する【JST・京大機械翻訳】

Integrative genomics analysis implicates decreased FGD6 expression underlying risk of intracranial aneurysm rupture
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発行年: 2022年04月22日  プレプリントサーバーでの情報更新日: 2022年04月22日
JST資料番号: O7002B  資料種別: プレプリント
記事区分: プレプリント  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
抄録/ポイント:
抄録/ポイント
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背景:頭蓋内動脈瘤破裂(rIA)の根底にある遺伝的決定因子と機序は,ほとんど知られていない。rIAの[ ̄]50%死亡率を考えると,高リスクの患者を同定するアプローチは,スクリーニング,診断および予防対策を知らせる。【目的】著者らの目標は,rIAの遺伝的基礎を同定し,特徴づけることであった。方法:ゲノムワイド関連研究(GWAS)は,rIA関連遺伝子座と遺伝子を同定し,特性化するために機能的ゲノムアプローチを用いる。rIAの24の公表されたGWASを横断してメタ分析を行った。一塩基多型(SNP),遺伝子-burden分析,および機能的ゲノミクスは,rIAの遺伝的危険因子を同定し,特徴付ける。【結果】著者らのコホートは,84,353の個人(7,843のrIA症例と76,510の対照)を含んだ。rs12310399(FGD6,OR=1.16)を含むrIAに対するゲノムワイド意義(p<5.0x10 ̄-8)に達する5つの独立した遺伝子座を同定し,これはrIAの以前のGWASに関与していなかった。次に,[ ̄]20,000遺伝子にわたる遺伝子レベルの変異-バーデンを定量し,FGD6(21のrIA関連SNPを含む)のみが,トランスクリプトーム全体の有意性に達した。発現量的形質遺伝子座(eQTL)マッピングは,rs12310399が動脈組織でFGD6遺伝子発現を減少させることを示す。次に,著者らは,切除手術中に得られた正常ヒト脳血管細胞の公的に利用可能な単一細胞RNA配列決定を利用して,血管周囲細胞中に存在しない3つの動脈系統のうちの1つでFGD6の高発現を同定した。これらデータは,FGD6の変化がrIAのリスクを生じることを示す。結論:FGD6を含むrIAに対する以前に未知のリスク遺伝子座を同定し,特徴づける。高リスク遺伝子座の解明は,rIAに罹患する患者を同定するための集団-遺伝的スクリーニングおよび臨床-遺伝的試験戦略のインストラクションであるかもしれない。ここで提示した材料には,No資金源源を用いた。【JST・京大機械翻訳】
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分類 (3件):
分類
JSTが定めた文献の分類名称とコードです
循環系の基礎医学  ,  遺伝的変異  ,  神経系の疾患 

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