Methylobacteriumの包括的な系統発生学は4つの進化的に異なるグループを明らかにし,葉圏の多様性を低下する【JST・京大機械翻訳】

Leducq, J.-B.; Sneddon, D.; Santos, M.; Condrain-Morel, D.; Bourret, G.; Martinez-Gomez, N. C.; Lee, J. A.; Foster, J. A.; Shapiro, B. J.; Kembel, S. W.; Sullivan, J.; Marx, C. J.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202212052438570 整理番号：22P0317984

Methylobacteriumの包括的な系統発生学は4つの進化的に異なるグループを明らかにし,葉圏の多様性を低下する【JST・京大機械翻訳】

Comprehensive phylogenomics of Methylobacterium reveals four evolutionary distinct groups and underappreciated phyllosphere diversity.

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発行年： 2022年03月13日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月13日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

Methylobacteriumは,土壌,淡水,特に葉圏に関連したメチロトローフ微生物のグループであり,その進化の歴史と分類学が不明瞭である生理学に関してよく研究されている植物の地上部である。最近の研究は,Methylobacteriumが以前に考えられていたよりも非常に多様であり,生態学的および系統発生学的にコヒーレントな分類学的属としてその状況を疑問視していることを示唆している。しかし,Methylobacteriumの分類学的および進化的研究は,主に葉圏以外の生息場所から分離されるモデル種に制限されており,遺伝子樹木,遺伝子含有量,またはシンテニーを調べるための包括的な系統ゲノム法を利用していない。葉圏を含む広範囲の生息場所から189のMethylobacteriumゲノムを分析することによって,水平遺伝子導入の影響を明確に説明しながら,ロバストな系統樹を推測した。Methylobacteriumは,異なるゲノムサイズ,GC含有量,遺伝子含有量およびゲノム構造により特性化される4つの進化的に異なる細菌群(すなわちA,B,C,D)を含み,Methylobacteriumゲノムの動的性質を明らかにした。59の記載された種の回復に加えて,著者らは45の候補種,主に葉圏関連を同定し,Methylobacterium多様性の貯水池として植物の重要性を強調した。Methylobacteriaceaeの祖先における植物根との自由生活様式からの古代の移行を推論し,次いで,Methylobacteriumの歴史における初期分岐がHGTによって非常に不明瞭である主要なグループ(A,B,D)の3つの葉圏会合が続いた。まとめると,著者らの研究はMethylobacterium分類学の徹底的再定義のための基礎を築く。【JST・京大機械翻訳】

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進化論一般 , 微生物形態学・分類学

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