抄録/ポイント:
抄録/ポイント
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DNAトランスポゾンTc1は,Caenorhabditis elegansで特性化される最初の転移性要素(TE)であり,今までに,Caenorhabditis ワームにおける最もよく研究されたTEのままである。Tc1コピー数は実験室N2/Bristolにおいて約30コピーで調節され,C.elegans株の大多数ではBergerac株とその誘導体は顕著なTc1増殖を経験した。C.elegansモデルの開発におけるBergerac株の歴史的重要性を考えると,著者らは,Tc1の(i)ゲノム分布,および(ii)宿主生物に対するTE脱調節の表現型結果をより良く解明するために,複数の表現型アッセイと併せて,3つのBergerac株(CB4851,RW699,およびRW7000)の現代のゲノム解析を実行したものである。”T.elegans”の最新のゲノム解析を実行した。”T_c1”のゲノム分布,および(ii)宿主生物に対するTE脱調節の表現型的帰結をよりよく解明するために,複数の表現型アッセイと併せて,著者らは3つのBergerac株(CB4851,RW699,およびRW7000)の最新のゲノム解析を実行した。Bergerac株におけるTc1コピー数の中央値推定は451から748の範囲であり,両者は(i)以前に推定したものより大きく,(ii)被覆に基づく推定とddPCR結果がより高いTc1数を示唆するので,(ii)実際のコピー数の過小評価であるらしい。3つのBergerac株はすべて4つの適応関連形質の各々に対してN2対照と比べて形質平均を有意に減少させ,特異的形質はBergerac株間で有意差を示した。Tc1増殖はゲノムワイドで,Tc1に特異的であり,特に染色体VとXで高かった。チャンスにより予想されるよりも高度に発現したクロマチン環境においてTc1挿入は少なかった。さらに,Tc1統合モチーフは,非コード配列よりもエキソンで頻度が低かった。Bergerac株におけるTc1の増殖の源はTc1に特異的であり,他のTEsには依存しない。Bergerac株はC.elegansにおいてTE活性を抑制することが分かっている対立遺伝子のどれも含まない。しかし,Bergerac株は,最近の生殖系列増殖を説明することができる高生殖系列転写遺伝子内または内において,いくつかのTc1挿入を有した。【JST・京大機械翻訳】