酵母細胞膜におけるSlg1膜貫通ドメインの脂質仲介会合【JST・京大機械翻訳】

Alavizargar, A.; Elting, A.; Wedlich Soeldner, R.; Heuer, A.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202212390066831 整理番号：21P0259246

酵母細胞膜におけるSlg1膜貫通ドメインの脂質仲介会合【JST・京大機械翻訳】

Lipid-mediated Association of the Slg1 Transmembrane Domains in Yeast Plasma Membranes

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発行年： 2022年01月12日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月12日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

膜貫通蛋白質のクラスタ化は,受容体活性化,側方ドメイン形成およびメカノトランスダクションのような細胞膜(PM)における多数の基本的な生物学的過程の基礎となる。また,それぞれの膜貫通ドメイン(TMD)の自己会合は出芽酵母形質膜における内在性膜蛋白質で見られるミクロンスケールパターンの原因であることが示唆されている。しかし,局所脂質組成とTMD同一性の間の基礎となる相互作用は,まだ機構的に理解されていない。本研究では,異なる脂質環境内のPMセンサSlg1からの代表的な螺旋酵母TMDの分布を分析するために,高分解能生細胞顕微鏡による単純化二分子層系の粗粒分子動力学(MD)シミュレーションを組み合わせた。著者らのシミュレーションにおいて,2つのTMDの会合に及ぼすアシル鎖飽和とアニオン性脂質頭基の影響を特に評価した。弱い脂質-蛋白質相互作用がTMD二量体の立体配置と会合の自由エネルギーに大きく影響することを見出した。不飽和リン脂質量の増加はヘリックス-ヘリックス相互作用を強く低下させたが,アニオン性ホスファチジルセリン(PS)の存在は二量体形成にほとんど影響しなかった。酵母細胞におけるPMパターン形成のメゾスコピック尺度であるネットワーク因子を用いたPSの影響の驚くべき欠如を実験的に確認した。また,シミュレーションはTMD二量体の形成が周囲の脂質の秩序パラメータを増加させ,脂質組織化における長距離摂動を誘導したことを示した。まとめると,著者らの結果は,複雑な脂質混合物中のTMDの脂質媒介二量化の機構に新たな光を投げかける。【JST・京大機械翻訳】

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蛋白質・ペプチド一般 , 生体膜一般

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