多発性嚢胞腎に対するエクソームシークエンシングの診断的有用性【JST・京大機械翻訳】

Chang, A.; Moore, B. S.; Luo, J. Z.; Sartori, G. A.; Fang, B.; Jacobs, S. A.; Abdalla, Y.; Taher, M. F.; Regeneron Genetics Center,; Carey, D. J.; Triffo, W.; Singh, G.; Mirshahi, T.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202212461954482 整理番号：22P0320133

多発性嚢胞腎に対するエクソームシークエンシングの診断的有用性【JST・京大機械翻訳】

Diagnostic Utility of Exome Sequencing for Polycystic Kidney Disease

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発行年： 2022年03月14日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月14日
JST資料番号： O7002B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

【背景】電子健康記録(EHR)と遺伝的データによる臨床コホートは,多嚢胞性腎臓病(PKD)のようなまれな遺伝的障害の集団罹患率を推定し,それらの遺伝学を解読し,より正確な診断と管理を可能にする。【方法】EHRとエキソーム配列決定データを有する173,954人の患者の未選択健康システムベースのコホートにおけるPKDの有病率と遺伝的基礎への洞察を得るために,遺伝子型と表現型ベースの分析を実施した。PKD1/2変異体の患者におけるPKDの診断率を測定し,種々の重症度の表現型PKD症例に利用可能な場合,画像および家族歴を含むEHRデータをレビューし,疾患有病率を決定し,これらの症例のほとんどに対する遺伝的基礎を同定した。【結果】遺伝子型一次分析において,PKD1およびPKD2における蛋白質切断(PTV)またはコピー数変異欠失(CNV)を有する個体は,それぞれ94.3%(66/70)および97.7%(43/44)のADPKD率を有した。おそらく病原性(LP)または低形態として分類されたミスセンスまたはインフレーム欠失変異体を有する個人に対して,ADPKD診断はまれであった(PKD1に対して34/425およびPKD2に対して0/12)。表現型1次分析は,235ADPKD症例(1.35/1000)を同定し,それは画像所見(196の中等度/重度の典型的ADPKD,16の軽度の典型的ADPKD,23の非定型ADPKD)によってさらにサブ分類された。中等度/重度の典型的ADPKDに対する遺伝的診断率は69%(135/196)であり,軽度典型的および非定型ADPKD(それぞれ25.0%および21.7%)に対して有意に低かった。特に,典型的ADPKDに対して,125/196(63.7%)はPKD1またはPKD2において診断(CNV/PTV/LP)変異体を有し,2つは以前にVUSとして分類されたPKD1ミスセンス変異体を有し,24は新規PKD1またはPKD2ミスセンス変異体を持ち,そのうち8つは家系分析においてADPKDと分離された。遺伝的診断収率は,家族歴のないそれらよりADPKDの家族歴を有する患者で非常に高かった。結論:大きな注意深く表現型化された臨床コホートからのデータは,PKDの集団ベースの有病率を提供し,ADPKD診断におけるエキソーム配列決定の有用性を確立し,PKDの早期診断と改善治療につながるべきである。【JST・京大機械翻訳】

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先天性疾患・奇形一般 , 先天性疾患・奇形の診断 , 遺伝学研究法 , 泌尿生殖器の腫よう , 泌尿生殖器の診断

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