相関性SIP-FISH-Raman-SEM-ナノSIMSは環境微生物のアイデンティティ,形態,生化学及び生理学を連結する【JST・京大機械翻訳】

Schaible, G. A.; Kohtz, A. K. J.; Cliff, J.; Hatzenpichler, R.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202212542490065 整理番号：22P0325951

相関性SIP-FISH-Raman-SEM-ナノSIMSは環境微生物のアイデンティティ,形態,生化学及び生理学を連結する【JST・京大機械翻訳】

Correlative SIP-FISH-Raman-SEM-NanoSIMS links identity, morphology, biochemistry, and physiology of environmental microbes

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発行年： 2022年05月14日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年05月14日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

顕微鏡および分光法は微生物細胞の研究に一般的に適用されるが,典型的には分離試料に使用され,ほとんど空間分解能で異なる細胞全体に統合される集団レベルデータセットをもたらす。この短所に取り組むために,著者らは,個々の細胞の徹底的な分析を生成するために,いくつかの顕微鏡および分光法を相関させるワークフローを開発した。安定同位体プロービング(SIP),蛍光in situハイブリダイゼーション(FISH),走査電子顕微鏡(SEM),共焦点Raman顕微分光法(Raman),およびナノスケール二次イオン質量分析(NanoSIMS)を組み合わせて,個々の細胞がそれらの分類学的同一性,構造,生理学,および代謝活性に関する情報を得るためにどのように完全にインタロゲートされるかを例示した。人工微生物群集の解析は,著者らの相関アプローチが,Ramanおよび/またはNanoSIMSと組み合わせた重水SIPを用いて単一細胞の活性を解決でき,FISHおよびSEMを用いてそれらの分類および形態を確立することを実証した。次に,このワークフローを未培養多細胞磁性細菌(MMB)の試料に適用した。それらの同一性と活性の確立に加えて,後方散乱電子顕微鏡(BSE),NanoSIMS,およびエネルギー分散X線分光法(EDS)を用いて,細胞内のマグネトソームを特性化した。これらの技術を統合することにより,単一細胞レベルでの環境微生物を徹底的に研究するための凝集アプローチを示した。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , 【Automatic Indexing@JST】

生体の顕微鏡観察法 , 生物物理的研究法

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