高度に分岐した海のスカートゲノム間の移入:適応ブレークスルー?【JST・京大機械翻訳】

Fraisse, C.; Le Moan, A.; Roux, C.; Dubois, G.; Daguin-Thiebaut, C.; Gagnaire, P.-A.; Viard, F.; Bierne, N.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202212578523407 整理番号：22P0318916

高度に分岐した海のスカートゲノム間の移入:適応ブレークスルー?【JST・京大機械翻訳】

Introgression between highly divergent sea squirt genomes: an adaptive breakthrough?

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発行年： 2022年09月06日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年09月06日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

ヒト媒介導入は,地球規模での種分布の再配分である。結果的に,異所性分類群数の増加は,現在接触し,不完全に分離した種と新しい適応遺伝子移動の間の侵入型ハイブリダイゼーションを促進する。ブロードキャスト産卵海洋種,Ciona robustaは,最近,その姉妹分類群,Ciona intestinalisの天然範囲に,英語海峡と北東大西洋で導入されている。これらの海草は高度に分岐しているが,交雑は野生における交差実験と遺伝学的研究によって報告されている。ここでは,英語チャンネルにおけるC.intestinalisとC.robustaの間の二次接触の結果を検討した。著者らは,分岐と遺伝子流動の歴史を推論するために,伝達によってフェイズされたゲノムを作成して,遺伝子移入されたゲノムトラクトを分析した。人口統計学的推論は,侵入の低い全体的速度を有する二次接触の歴史を明らかにした。移入した管は短く,低頻度で分離して,ゲノムを通して散乱し,最後の30kyの間,過去の接触の痕跡を示唆した。しかし,著者らはC.intestinalisにおける数百kb長のC.robustaのハプロタイプ分離を特徴とする染色体5への移入のホットスポットも明らかにし,最近75年間,現代の時期に移入した。遺伝子移入のベースラインレベルよりも局所的に高頻度であるが,C.ロバストa対立遺伝子は移入ホットスポットのコア領域でも固定されない。それでも,連鎖不均衡パターンとハプロタイプに基づく試験は,このゲノム領域が最近の正の選択下にあることを示唆する。さらに,侵入した対立遺伝子におけるタンデム反復の高いコピー数を有するチトクロームP450遺伝子上に存在する候補SNPの過表現をホットスポットにおいて検出した。チトクロームP450は外因性化合物の解毒に関与する酵素のスーパーファミリーであり,機能的研究のための有望な道筋を構成する。これらの知見から,適応対立遺伝子の移入は,非常に分岐したゲノム間で可能であり,人為的ハイブリダイゼーションは,アントロポセンにおける天然系統の適応のための原材料を提供できることを支持した。【JST・京大機械翻訳】

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進化論一般 , 個体群生態学

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