プレプリント
J-GLOBAL ID:202202212583882334   整理番号:22P0334956

2つの遺伝性前立腺癌コホートにおけるDNA損傷修復遺伝子の生殖系列配列決定は稀なリスク関連変異体を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Germline sequencing of DNA-damage-repair genes in two hereditary prostate cancer cohorts reveals rare risk-associated variants
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発行年: 2023年05月04日  プレプリントサーバーでの情報更新日: 2023年05月04日
JST資料番号: O7002B  資料種別: プレプリント
記事区分: プレプリント  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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【背景】DNA損傷修復(DDR)遺伝子における遺伝性変異体は,前立腺癌(PrCa)感受性において重要な役割を果たす。【目的】疾患リスクに寄与するまれなDDR変異体を同定するために,2つの独立した高リスク家族性PrCaデータセットを検査する。オーストラリアと北アメリカの家族性PrCaデータセットからのデザイン的並列配列決定データを,35DDR遺伝子における希少で,恐らく有害な変異体に対して調べた。推定高リスク変異体を頻度(マイナー対立遺伝子頻度<1%),変異型(ナンセンス,ミスセンスまたはスプライス),疾患による分離,およびin silico予測有害性に基づいて優先順位付けした。6つの前炎変異体を合計1,963人(700家族性および459散発性PrCa症例,482人の非罹患者および322人のスクリーニング対照)およびMQLS関連分析を実施した。【結果】ERCC3(rs145201770,p=2.57x10 ̄-4)およびBRIP1(rs4988345,p=0.025)におけるPrCaリスクとまれな変異体との間の統計的有意な関連性を,オーストラリアおよび北アメリカのデータセットの組み合わせにおいて同定した。(rs145201970,p=2.57x10 ̄-4)およびBRIP1(rs4988345,p=0.025)。PARP2の変異体(rs200603922,p=0.028)は,オーストラリアのデータセットのみのリスクと有意に関連していたが,MUTYHの変異体(rs36053993,p=0.031)は北アメリカのデータセットにおけるリスクと有意に関連していた。推定病原性変異体は,データセットにおける非常に低い頻度により見逃され,統計的評価を排除する。結論:本研究は,他のPrCaコホートにおける遺伝性リスクにおける機能的および/または生物学的影響および役割を評価すべきであるPrCaリスクにおける複数のまれな生殖系列DDR変異体を関連づける。これらの知見は,PrCa患者におけるDDR経路を標的とする遺伝子に基づく治療法の使用に有意に影響するであろう。患者SummaryHereは,そのような遺伝的変化に対する試験がPrCa診断と治療において重要であることを証明するので,DNA修復に関与する遺伝子のグループにおける遺伝的変化を調査した。PrCaに関連するこれらの遺伝子のいくつかの新しい遺伝的変化を初めて報告した。【JST・京大機械翻訳】
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分類 (2件):
分類
JSTが定めた文献の分類名称とコードです
分子遺伝学一般  ,  臨床腫よう学一般 

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