ショウジョウバエの日周トランスクリプトームにおける年齢依存的パターンの発見と可視化【JST・京大機械翻訳】

Sebastian, B.; Fey, R.; Morar, P.; Lasher, B.; Chow, E.; Giebultowicz, J.; Hendrix, D. A.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202212741521654 整理番号：22P0330551

ショウジョウバエの日周トランスクリプトームにおける年齢依存的パターンの発見と可視化【JST・京大機械翻訳】

Discovery and Visualization of Age-dependent Patterns in the Diurnal Transcriptome of Drosophila

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発行年： 2022年04月08日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年04月08日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

多くの重要な生命プロセスは,代謝,細胞ホメオスタシスおよび解毒のような24時間外部光/暗サイクルからの入力によって調節される。概日時計は,これらの日光/暗周期に対する応答を協調させるのを助け,寿命にわたって律動する。しかし,正常加齢の間に,律動的転写産物発現が変化した。加齢がどのように日周発現に影響するかをより良く理解するために,他の期間(RP24)と比較して24時間周期の相対電力に基づくリズムの検出と可視化のための改良Fourierベース法を示した。若い(5日)および古い(55日)Drosophila melanogasterの頭部から転写物レベル発現プロファイルにRP24を適用し,遺伝子レベルでマスクされる可能性のある新しい年齢依存性リズム変化を明らかにした。コアクロック転写物は加齢時に前進し,一方,ほとんどのリズム転写位相遅延は遅延することを示した。若いハエのみの転写産物は,光の前にピークに達する傾向があり,一方,転写産物は,光の後,古いピークで律動するだけであった。著者らは,グルタチオン代謝,獲得,または年齢による協調リズム発現を含むいくつかの経路が,年齢発症神経変性の可能な機構への洞察を提供することを示す。注目すべきことに,著者らは,多くの経路が寿命にわたって非常にロバストな協調リズムを示し,神経健康を促進するそれらの推定上の役割を強調する。著者らは,これらのリズム変化に関与する可能性がある,統計学的に豊富な転写因子結合部位モチーフを調べた。【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子発現

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