侵入性森林病原性真菌における遺伝子および転位因子の安定レパートリーによる染色体再配列【JST・京大機械翻訳】

Demene, A.; Laurent, B.; Cros-Arteil, S.; Boury, C.; Dutech, C.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202212753125215 整理番号：21P0247422

侵入性森林病原性真菌における遺伝子および転位因子の安定レパートリーによる染色体再配列【JST・京大機械翻訳】

Chromosomal rearrangements with stable repertoires of genes and transposable elements in an invasive forest-pathogenic fungus

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発行年： 2022年03月07日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月07日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

AO_SCPLOWBSTRACTC_SCPLOWChromomer転位は真核生物間で主に記述されており,種の進化に重要な結果を持つ可能性がある。高ゲノム可塑性はFungiでしばしば報告されており,それは新しい環境に迅速に適応するそれらの見かけの能力を説明するかもしれない。Cryphonectria寄生虫症は, Chest疫病を引き起こし,アジアから北アメリカおよびヨーロッパへの継続的な導入時に,いくつかの最近の宿主シフトと関連する侵襲性真菌病原体種である。以前の細胞学的核型分類とゲノム研究は,この種に関して詳細に記述されていないいくつかの染色体再配列を示唆した。有効なゲノム比較の重大な限界は,通常,低複雑性のゲノム領域を含むロバストなゲノムアセンブリへのアクセスである。種の天然地域でサンプリングされた日本分離株から得られたDNA抽出と長読取配列決定ナノポア技術の新しい方法から得られた新規de novo全ゲノムアセンブリを提示した。最近発表された参照ゲノムとの比較は,安定な遺伝子と転移可能な要素(TEs)レパートリーを明らかにした。また,C.parasiticaゲノムは,宿主相互作用(すなわち,小分泌蛋白質または二次代謝産物に対する遺伝子コード)に潜在的に関与するようなTEと遺伝子間の弱い会合を伴って,低区画化されることを示した。しかし,このゲノム比較は,この侵入種における遺伝子調節と性的交配に重要な結果を持つかもしれないいくつかの大きな染色体再配列を検出した。本研究は,高品質集合ゲノムのより多くの比較の道を開き,この真菌病原体種の侵入成功における構造変化の役割を疑問にする。【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子の構造と化学

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