ヒトオキシトシン受容体遺伝子(OXTR)のDNAメチル化景観:未来研究の推奨【JST・京大機械翻訳】

Mueller, S.; Sicorello, M.; Moser, D. A.; Frach, L.; Limberg, A.; Gumpp, A. M.; Ramo-Fernandez, L.; Koehler-Dauner, F.; Fegert, J. M.; Waller, C.; Kumsta, R.; Kolassa, I.-T.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202212800399450 整理番号：22P0318373

ヒトオキシトシン受容体遺伝子(OXTR)のDNAメチル化景観:未来研究の推奨【JST・京大機械翻訳】

The DNA methylation landscape of the human oxytocin receptor gene (OXTR): Recommendations for future research

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発行年： 2022年03月16日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月16日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

オキシトシン受容体遺伝子(OXTR)は,DNAメチル化に対する初期敵対の効果を調べる際に興味深い。しかし,分析の標的に対する最も有望なCpG部位の選択に関する不均一性がある。本研究の目的は,113の母親-乳児ダイアドにおけるOXTR CpG島内のCpG部位の機能的関連クラスターを決定することであり,母親のうち58人が小児期異常治療(CM)を経験した。OXTR DNAメチル化と遺伝子発現を末梢/臍血液単核細胞で分析した。異なる複雑性低減法を用いて,188CpG部位を共メチル化部位のクラスタに還元した。さらに,OXTR DNAメチル化(クラスターと部位特異的レベル)とOXTR遺伝子発現とCMの間の関係を調べた。結果は,最初に,CpG切片がDNAメチル化における個々の差の研究に対する統計的有用性に関して強く異なることを示した。第2に,クラスター分析と部分最小二乗(PLS)は,それぞれ,イントロン1/エクソン2とエキソン3の蛋白質コード領域からなる2つのクラスタを,結果測定と最も強く関連していた。第3に,交差検証PLS回帰は,CMの7%の分散を説明し,遺伝子発現の予測のために低い交差検証分散を説明した。第4に,非常に高い母子対応が,同定されたクラスタ内の相関パターンで観察されたが,これらのクラスターの外でわずかな対応しかなかった。本研究では,望ましい統計的性質と予測値を示すCpG部位のクラスターを強調することによりOXTR CpG島のDNAメチル化景観を特性化した。著者らは,CpG部位の選択における将来の研究を導くために,コンパニオンWebアプリケーションを提供した。【JST・京大機械翻訳】

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中枢神経系 , 個生態学 , 遺伝的変異

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