スパイク糖蛋白質を横切る変異性パターンはSARS-CoV-2の分岐と系統特異的進化空間を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Rojas Chavez, R. A.; Fili, M.; Han, C.; Rahman, S. A.; Bicar, I. G. L.; Gregory, S.; Hu, G.; Das, J.; Brown, G. D.; Haim, H.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202213003251681 整理番号：22P0314092

スパイク糖蛋白質を横切る変異性パターンはSARS-CoV-2の分岐と系統特異的進化空間を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Mutability Patterns Across the Spike Glycoprotein Reveal the Diverging and Lineage-specific Evolutionary Space of SARS-CoV-2.

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発行年： 2022年06月24日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年06月24日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

SARS-CoV-2のスパイク糖蛋白質の変異は,ウイルスがより高い適合状態の探索で配列空間をプローブすることを可能にする。SARS-CoV-2変異型(VOCs)の新しいサブラインは,このような変異と共に連続的に出現する。興味深いことに,これらの亜系統における突然変異のサイトはVOCs間で異なる。そのような違いが,VOCsにおけるスパイクの突然変異出現または異なる進化空間のランダム性質を反映するかどうかは不明である。ここでは,スパイクの各位置が変異の系統特異的尤度を持ち,子孫のサブラインを支配し,支配することを示した。この尤度は,蛋白質全体のレベルでスパイクの系統特異的変異プロファイルから正確に推定できる。各位置の変異性環境は,蛋白質構造上の隣接部位と交換性ネットワーク上の隣接部位を含み,子孫のサブラインの変化を正確に予測した。VOCs内の顕著な変化のマッピングは,SARS-CoV-2の将来の形を扱う免疫原と治療薬の設計に寄与する。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , 【Automatic Indexing@JST】

進化論一般 , ウイルスの生化学

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