構造化および半構造化バイオインフォマティクスツールの性能評価:比較研究【JST・京大機械翻訳】

Moftah Raja A.; Maatuk Abdelsalam M.; White Richard

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202213057256514 整理番号：22P0284971

構造化および半構造化バイオインフォマティクスツールの性能評価:比較研究【JST・京大機械翻訳】

Performance Evaluation of Structured and Semi-Structured Bioinformatics Tools: A Comparative Study

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発行年： 2022年02月04日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年02月04日
JST資料番号： O7000B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

※このプレプリント論文は学術誌に掲載済みです。なお、学術誌掲載の際には一部内容が変更されている可能性があります。

生物学的データを抽出するための異なる方法を採用して,バイオインフォマティクス専門家によって開発された広範囲の利用可能な生物学的データベースがある。本論文では,Webベースインタフェイスを用いてバイオインフォマティクスデータベースを効率的にアクセスする能力に関して,これらの方法のいくつかの性能を調べ,評価した。これらの方法は,遠隔データベースサーバからのデータを検索できる構造化および半構造化データツールを用いてバイオインフォマティクス情報を検索する。本研究は,これらのアプローチのそれぞれを区別し,これらのツールを対比する。構造化データのためのシーケンス検索システム(SRS)とEntrez探索ツールを使用し,一方,テキストと数値情報の組合せを含む複雑なクエリを検索するために,PerlとBioPerl検索プログラムを半構造化データのために使用した。本研究は,バイオインフォマティクスデータベースにアクセスするための半構造化データツールの使用が,構造化ツールに対する実行可能な代替法であるが,各方法は,ある固有の利点と欠点を持つことを示す。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , 【Automatic Indexing@JST】

分子・遺伝情報処理 , 分子遺伝学一般 , 生物科学研究法一般

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