統合単一細胞および空間トランスクリプトーム解析は前立腺腫瘍微小環境の不均一性を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Hirz, T.; Mei, S.; Sarkar, H.; Kfoury, Y.; Wu, S.; Verhoeven, B. M.; Subtelny, A. O.; Zlatev, D. V.; Wszolek, M. W.; Salari, K.; Murray, E.; Chen, F.; Macosko, E. Z.; Wu, C.-L.; Scadden, D. T.; Dahl, D. M.; Baryawno, N.; Saylor, P. J.; Kharchenko, P. V.; Sykes, D. B.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202213062980417 整理番号：22P0318564

統合単一細胞および空間トランスクリプトーム解析は前立腺腫瘍微小環境の不均一性を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Integrated single-cell and spatial transcriptomic analyses unravel the heterogeneity of the prostate tumor microenvironment

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資料名：
発行年： 2022年03月19日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月19日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

原発性前立腺癌の治療は,ハイリスク疾患に対する手術,放射線療法およびホルモン療法を含むマルチモーダル治療を伴う低リスク疾患に対する能動的サーベイランスアプローチを繊細にバランスさせる。転移性疾患の再発と発達は,免疫逃避と腫瘍進行を駆動する明確な理解なしに,臨床的問題である。ここでは,局所前立腺癌の腫瘍微小環境を,隣接正常試料および健常対照者と対照して包括的に記述することを試みた。単細胞RNA配列決定および高分解能空間トランスクリプトミクス分析を行った。これは,遺伝子発現における腫瘍状況依存性変化を明らかにした。著者らのデータは,高間質血管新生活性に加えて,抑制性骨髄集団および消耗T細胞と関連する免疫抑制腫瘍微小環境に向けた。非解離組織切片内のリガンド-受容体相互作用に対する前例のないスケールでの細胞間関係を推定した。本研究は,腫瘍-間質細胞相互作用と同様に前立腺腫瘍微小環境の非常に詳細で包括的な資源を提供する。scRNA-seqと空間トランスクリプトミクス解析C_LIO_LIPrimary前立腺癌との組み合わせによる前立腺癌の高光O_LI特性化は,抑制性免疫微小環境C_LIO_LIを樹立し,前立腺腫瘍微小環境は,文脈特異的差次的遺伝子発現C_LIをデコンボリューションするための高い血管新生遺伝子発現パターンC_LIO_LIA新規計算解析パイプラインを示す。【JST・京大機械翻訳】

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腫ようの化学・生化学・病理学

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