LiveCellMiner:有糸分裂進行解析のための新しいツール【JST・京大機械翻訳】

Moreno-Andres, D.; Bhattacharyya, A.; Scheufen, A.; Stegmaier, J.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202213166480505 整理番号：21P0273041

LiveCellMiner:有糸分裂進行解析のための新しいツール【JST・京大機械翻訳】

LiveCellMiner: A New Tool to Analyze Mitotic Progression

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発行年： 2022年03月17日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月17日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

ライブ細胞イメージングは,有糸分裂と細胞周期欠陥の性質を正確に同定する最先端技術になっている。低およびハイスループット顕微鏡セットアップは,異なる実験的および病理学的条件で記録した細胞の膨大なデータ量をもたらした。Tailored semi-自動化および自動画像解析法は,高コンテンツスクリーニングデータセット,節約時間,およびバイアスを避けることができる。しかし,それらは,それらの柔軟性と使用性を制限する非常に特殊な実験装置のために大部分設計された。専用の実験特有のユーザ注釈付き訓練セットと実験特有のユーザ定義セグメンテーションパラメータに対する一般的必要性は,解析プロセスを完全に自動化するための主要なボトルネックである。本研究では,潜在的生物学的関連性を有する凝集および時間分解画像特徴を自動的に抽出,解析,可視化するための高度に柔軟なオープンソースソフトウェアツールであるLiveCellMinerを提案した。ソフトウェアツールは,定量的で不偏な方法で,異なるプラットフォームで得られた高コンテンツデータセットを分析できる。原理応用の証明として,著者らは,このツールセットの多目的で柔軟な可能性を強調する有糸分裂を通して通過するヒト細胞における動的クロマチンとチューブリン細胞骨格の特徴を解析した。【JST・京大機械翻訳】

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, , , 【Automatic Indexing@JST】

生体の顕微鏡観察法 , 医用画像処理

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