遷移経路アンサンブルにおける時間遅延フラックス:フラックス最大化と遷移経路理論との関係【JST・京大機械翻訳】

Li, W.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202213412598600 整理番号：22P0316249

遷移経路アンサンブルにおける時間遅延フラックス:フラックス最大化と遷移経路理論との関係【JST・京大機械翻訳】

Time-lagged Flux in the Transition Path Ensemble: Flux Maximization and Relation to Transition Path Theory

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発行年： 2022年03月31日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月31日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

遷移経路集合は反応座標同定に特に興味があり,反応物状態から開始する反応軌跡と生成物中の末端からなっている。遷移経路集合を記述するための理論的枠組みとして,遷移経路理論を10年以上前に導入し,その適用はいくつかの低次元系で例示されてきた。遷移経路集合を考えて,フラックス,電流(ベクトル場),および主曲線を計算するための表現を,遷移経路理論からの集団変数の空間においてここで導き,それらは,高次元系の分子動力学シミュレーションから得られた時系列,すなわち,遷移経路集合における時間の関数としての位置座標に適用できる。遷移経路理論の連結を密度加重平均フラックスに行い,反応座標[W.Li,J.Chem.Phys.156,054117(2022)]に対する座標の関連性を評価するために以前の研究で提案した量である。最も重要なことに,既存の量の拡大として,フラックスや電流のような時間遅れ量も提案した。これらの時間遅れ量によって提供された主な洞察と対象物を,真空中のアラニンペプチドへの応用で例証した。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , 【Automatic Indexing@JST】

反応速度論・触媒一般

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