重症感染中のStaphylococcus aureus適応を形成するニッチ特異的ゲノム分解と収束進化【JST・京大機械翻訳】

Giulieri, S. G.; Guerillot, R.; Duchene, S.; Hachani, A.; Daniel, D.; Seemann, T.; Davis, J. S.; Tong, S. Y.; Young, B. C.; Wilson, D. J.; Stinear, T. P.; Howden, B. P.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202213556246554 整理番号：22P0315081

重症感染中のStaphylococcus aureus適応を形成するニッチ特異的ゲノム分解と収束進化【JST・京大機械翻訳】

Niche-specific genome degradation and convergent evolution shaping Staphylococcus aureus adaptation during severe infections

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発行年： 2022年02月12日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年02月12日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

重症感染中,Staphylococcus aureusは,そのコロニー形成部位から血液および組織へ移動し,新しい選択的圧力に曝露され,従って適応進化を潜在的に駆動する。以前の研究は,S.aureusの病理適応におけるagr遺伝子座の重要な役割を示しているが,細菌適応の遺伝的特徴のより包括的な特性化は,臨床転帰の予測を可能にし,これらの感染の治療および予防のための新しい標的を明らかにする。ここでは,感染の396の独立したエピソードから2,590のS.aureusゲノムの宿主内進化分析を用いた適応を測定した。単一ヌクレオチドおよび構造ゲノム変異の包括的なレパートリーを捉えることによって,コロニー化細菌と比較して感染集団内の特徴的な進化パターンの証拠を見出した。これらの侵入株はゲノム分解シグネチャに対して最大20倍濃縮し,抗生物質応答および病因にリンクした特徴的な遺伝子セットにおいて有意な収束変異を示した。agr仲介適応に加えて,sucA-sucB及びstp1を含む非標準ゲノムワイド遺伝子座を同定した。適応変化の罹患率は感染範囲と共に増加し,これらの特徴の臨床的意義を強調した。これらの知見から,S.aureusがコロニー形成から重度の感染へ移行する時,分子変化の高分解能像が得られ,適応シグネチャとの感染結果の相関を知らせる可能性がある。【JST・京大機械翻訳】

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進化論一般 , 微生物感染の生理と病原性

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