定量的細胞プロテオミクスアトラス:細胞シグナリングの高分解能機能プロファイリングのための経路スケール標的化質量分析【JST・京大機械翻訳】

Cifani, P.; Kentsis, A.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202213642169198 整理番号：22P0334582

定量的細胞プロテオミクスアトラス:細胞シグナリングの高分解能機能プロファイリングのための経路スケール標的化質量分析【JST・京大機械翻訳】

Quantitative Cell Proteomic Atlas: Pathway-scale targeted mass spectrometry for high-resolution functional profiling of cell signaling

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発行年： 2022年04月14日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年04月14日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

細胞シグナリングの広範な研究にもかかわらず,経路統合,クロストークおよびフィードバックのような多くの基本的過程はほとんど理解されていない。細胞生化学活性の統合および定量的測定を可能にするために,定量的細胞プロテオミクスAtlas(QCPA)を開発した。QCPAは,ヒト細胞におけるほとんどの既知の生理学的および病原性シグナル伝達経路からのセンチネル蛋白質の調節翻訳後修飾の豊度および化学量論を決定するために,標的質量分析アッセイのパネルから成る。QCPAは,細胞表面シグナル伝達,アポトーシス,ストレス応答,遺伝子発現,静止,および増殖の469エフェクターから,現在,1,913ペプチドをプロファイルする。各蛋白質について,QCPAは既知の翻訳後調節部位をカバーする同位体標識ペプチドの三重項を含み,それらの化学量論と未修飾蛋白質領域を決定し,総蛋白質量を測定した。QCPA骨格は,化学的に修飾した残基を含む蛋白質に対する蛋白質分解効率の正確な定量化のための合成基質,TrypQuantを含む試料調製と質量分析の技術的変動性を制御するために検体を組み入れる。既知のシグナル伝達経路を精密かつ正確に定量する能力は,診断標本の細胞シグナル伝達および臨床プロテオミクスの包括的な分析のための化学プロテオミクスアプローチの改善を可能にする。QCPAはhttps://qcpa.mskcc.orgでオープンに利用できる。【JST・京大機械翻訳】

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細胞生理一般 , 遺伝子発現

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