メタゲノム次世代シークエンシング解析の性能指標に関する考察【JST・京大機械翻訳】

Kralj, J. G.; Servetas, S. L.; Forry, S. P.; Jackson, S. A.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202213753364496 整理番号：22P0255921

メタゲノム次世代シークエンシング解析の性能指標に関する考察【JST・京大機械翻訳】

Considerations for performance metrics of metagenomic next generation sequencing analyses

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発行年： 2020年12月17日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年12月17日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

メタゲノム解析の性能を評価することは,一部は,限られた地上標準,広い応用空間,および多数の評価手法とメトリックスのために,課題を証明した。分類学的分類器を用いた従来の臨床成績計量(すなわち,感度,特異性など)の応用は,「ワンブグワンテスト」パラダイムに適合しない。最後に,ユーザは,適応度を評価し,それらの分析強度と弱点を同定する方法を必要とする。定義されたコホート内では,サンプルによるよりも,分類群による性能指標の報告は,この評価を明らかにするであろう。検出限界,正及び負の対照試料,及び真の正及び負の真の結果は,調べたすべての分類群に対して必要な基準であった。要約計量の使用は,類似のコホートとデータの比較に制限されるべきであり,算術平均よりも各性能計量に対して調和平均と連続製品を採用するべきである。このような考察は,目的の有意義な比較と評価を確実にする。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , , , , , , 【Automatic Indexing@JST】

パターン認識 , 図形・画像処理一般

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