抄録/ポイント：
抄録/ポイント
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クロマチン免疫沈降(ChIP)はin vivoで蛋白質-DNA結合を特性化する重要な技術である。ChIPベース技術の1つの欠点は,複雑な組織をプロファイリングするときの細胞型特異性の欠如である。この制限を克服するため,SpyChIPを開発し,組織解離または核ソーティングなしに,天然の生理的状況における細胞型特異的転写因子(TF)結合部位を同定した。SpyChIPは15アミノ酸SpyTagと17kD蛋白質SpyCatcherの間に迅速に形成される特異的共有結合イソペプチド結合を利用する。SpyChIPでは,標的TFはゲノム工学によりSpyTagと融合し,エピトープ標識SpyCatcherは興味ある細胞集団で発現し,SpyTag-TFに共有結合する。細胞型特異的ChIPはエピトープ標識SpyCatcherに対する抗体を用いて全組織から調製したクロマチンを免疫沈降することによって得られる。SpyChIPを用いて,Drosophila haltereディスクの2つの異なる細胞型におけるHox蛋白質Ubxのゲノムワイド結合プロファイルを同定した。著者らの結果は,広範な領域特異的Ubx-DNA結合事象を明らかにし,細胞型特異的ChIPの意義と全組織ChIPアプローチの限界を強調した。Ubx::SpyChIP分析の結果はクロマチンアクセシビリティとUbx-DNA結合間の関係に新しい洞察を提供し,異なる機構Ubxは下流シス調節モジュール(CRM)を調節するのに用いた。SpyChIPに加えて,SpyTag-SpyCatcher技術および他の共有結合相互作用ペプチド対は,以前に達成できない多くのin vivo応用を有することを示唆した。【JST・京大機械翻訳】
