抄録/ポイント:
抄録/ポイント
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材料および燃料合成から医薬品および食品生産に至るまで,多重産業および科学における酵素の三日月使用がある。この多様な分野における応用性は,それらの生化学的機能だけでなく,それらの物理化学的性質にも依存する。本研究では,コインシデンス方法論を用いて,グリコシドヒドロラーゼファミリー13の7つのよく研究された酵素の類似ネットワークを構築し,物理化学的に関連する酵素のコミュニティを同定した。より具体的には,選択した酵素の各々をネットワークノードにマッピングし,一方,酵素のペア間のリンクを,関心のある選択した物理化学的特徴間の一致類似性によって決定する。得られたネットワークには,コインシデンス方法論に含まれる2つのパラメータに対してそれぞれ最適化されるモジュール性と分離ノードの数があり,その結果,高モジュールネットワークをもたらした。酵素関係に対する考慮された物理化学的特徴の影響を調べるために,一致ベースの方法も適用して,あらゆる可能な特徴の組み合わせによって得られた酵素類似性ネットワークが特徴組合せネットワークのノードとなり,それらのネットワーク間の一致類似性がそれぞれのリンクを定義する。得られた特徴組合せネットワークは,酵素類似性に対する選択した物理化学的特徴の影響を系統的に包括的に示した。いくつかの興味深い結果を報告し,触媒クラス内の類似の物理化学的特徴を持つ酵素のサブグループの同定を含み,標的バイオテクノロジー応用のための酵素の選択と設計に重要な情報を提供した。【JST・京大機械翻訳】