TreeSearch:Rにおける形態学的系統発生解析【JST・京大機械翻訳】

Smith, M. R.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202213962136018 整理番号：21P0272107

TreeSearch:Rにおける形態学的系統発生解析【JST・京大機械翻訳】

TreeSearch: morphological phylogenetic analysis in R

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発行年： 2022年01月25日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月25日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

樹木Searchは,形態学的データセットのために最適化した系統発生分析のためのRパッケージである。ツリー探索は,標準節約法に固有の落とし穴のいくつかを避けて,適用不能な文字入力に対する明示的(非厳密性)許容値を有する等または意味ステップ重みを用いて行われる可能性がある。プロファイル節約とユーザ指定最適性基準をサポートした。Rとの親密性を必要としないグラフィカルインタフェイスは,ユーザが,アンダーピニング文字符号化の批判的レビューを通してデータセットの品質を改善するのを助けるように設計されている。そして,類似した樹木のクラスタを同定して,要約することによって,結果から追加情報を得て,樹木の分布のマッピングと,根底にある関係性を不明瞭にするローグ分類群を除去する。まとめると,パッケージは,データ収集,分析,および系統発生結果の調査の各段階で方法論的厳密さを支援することを目的とする。【JST・京大機械翻訳】

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, , , 【Automatic Indexing@JST】

進化論一般 , 分子・遺伝情報処理

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