H4K16acは転位因子の転写を活性化し,そのシス調節機能に寄与する【JST・京大機械翻訳】

Pal, D.; Patel, M.; Boulet, F.; Sundarraj, J.; Grant, O. A.; Branco, M. R.; Basu, S.; Santos, S.; Zabet, N. R.; Scaffidi, P.; Pradeepa, M. M.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202213987391012 整理番号：22P0343214

H4K16acは転位因子の転写を活性化し,そのシス調節機能に寄与する【JST・京大機械翻訳】

H4K16ac activates transcription of transposable elements and contribute to their cis regulatory function

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著者 (11件)： , , , , , , , , , ,
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発行年： 2022年11月16日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年11月16日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

哺乳類ゲノムは多数の転移性要素(TEs)とそれらのレムナントを収容する。多くのエピジェネティック抑制機構はTE転写をサイレンシングすることが知られている。しかし,TEは初期発生,ニューロン系統および癌においてアップレギュレートされるが,TEsの転写に寄与する後成的因子はまだ完全には解明されていない。ここでは,ヒストンH4リジン16(H4K16ac)の雄性特異的致死(MSL)複合体が仲介するアセチル化が,長い散在した細胞核要素(LINE1,L1)と長い末端反復(LTRs)の転写を活性化することを示した。さらに,H4K16ac標識L1及びLTRサブファミリーはエンハンサーとして機能し,活性エンハンサー及びループ因子と関連するクロマチン特徴に富むことを示した。ヒストンアセチル化に富むL1とLTRはクロマチンループ因子と遺伝子を持つこれらの領域ループによって結合した。L1sのCRISPRに基づく後成的摂動と遺伝的欠失は,H4K16ac標識L1sとLTRがシスにおける遺伝子発現を調節することを明らかにした。全体として,H4K16acに富むTEは,TEsで活性クロマチン景観を維持することにより,哺乳類ゲノムのかなりの部分のシス調節景観に寄与する。1つのSentence SummaryH4K16acはLINE1とERV/LTR転写を活性化し,TEsでの転写活性を増加させることにより哺乳類ゲノムのかなりの部分のシス調節景観を再構築する。【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子発現

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