多重合成染色体のデバッギングと固定化は組合せ遺伝的相互作用を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Zhao, Y.; Coelho, C.; Hughes, A. L.; Lazar-Stefanita, L.; Yang, S.; Brooks, A. N.; Walker, R. S. K.; Zhang, W.; Lauer, S.; Hernandez, C.; Mitchell, L. A.; Agmon, N.; Shen, Y.; Sall, J.; Fanfani, V.; Jalan, A.; Rivera, J.; Liang, F.-X.; Stracquadanio, G.; Steinmetz, L. M.; Cai, Y. P.; Boeke, J. D.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202214028383988 整理番号：22P0330973

多重合成染色体のデバッギングと固定化は組合せ遺伝的相互作用を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Debugging and consolidating multiple synthetic chromosomes reveals combinatorial genetic interactions

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資料名：
発行年： 2022年04月11日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年04月11日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

Sc2.0プロジェクトは,数千の設計者特徴を組み込んだスクラッチから真核生物合成ゲノムを構築する。すべての個々のSc2.0染色体の集合で主要なマイルストーンを達成した。ここでは,6.5合成染色体を持つ菌株を生成するために,内部複製交雑を用いた複数の合成染色体の圧密について述べた。ゲノムワイド染色体立体配座捕捉および長読取直接RNA配列決定を,この株で実施し,3D染色体構成および転写物イソ型プロファイルに及ぼすloxPsym部位挿入,tRNA再配置およびイントロン欠失のようなデザイナー修飾の影響を評価した。「bugs」を正確にマッピングするために,著者らは,ヘテロ接合性二倍体における有向有糸分裂組換えを利用する,CRISPR Directed Biallelic URA3支援ゲノムScanまたはCRISPR D-BUGSを開発した。この方法を用いて,SHM1の3’UTRの2つのloxPsym部位から生じるsynII欠損をまず精密にマッピングした。このアプローチを用いて,synIIIとsynXに関連するコンビナトリアルバグをマッピングし,転写調節,イノシトール代謝及びtRNASerCGA存在量をリンクする高度に予想外の遺伝的相互作用を明らかにした。tRNASerCGAの「飢餓」は,タンデムUCGコドンを含む,重要な正のイノシトール生合成レギュレーター,Swi3の不十分なレベルを生じる。最後に,強化をさらに促進するために,著者らは,最大染色体(synIV)を組み込むために,新しい方法,染色体スワッピングを採用し,それによって,単一株においてSc2.0ゲノムの半分以上を固めた。【JST・京大機械翻訳】

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, 【Automatic Indexing@JST】

遺伝子の構造と化学

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