HAX1蛋白質のRNA結合景観はリボソーム生合成と翻訳への関与を示す【JST・京大機械翻訳】

Balcarak, A.; Macech-Klicka, E.; Wakula, M.; Tomecki, R.; Goryca, K.; Rydzanicz, M.; Szostakowska-Rodzos, M.; Chmielarczyk, M.; Wisniewska, M.; Lyczek, F.; Helwak, A.; Tollervey, D.; Kudla, G.; Grzybowska, E.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202214187108157 整理番号：22P0032628

HAX1蛋白質のRNA結合景観はリボソーム生合成と翻訳への関与を示す【JST・京大機械翻訳】

The RNA-binding landscape of HAX1 protein indicates its involvement in ribosome biogenesis and translation.

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発行年： 2022年06月20日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年06月20日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

HAX1は,既知同族体または構造ドメインを持たないヒト蛋白質であり,その変異は,あまり理解されていない機構を介し,重度の先天性好中球減少を生じる。以前の研究はHAX1のRNA結合能を報告したが,生理学と病理学におけるこの結合の役割は不明のままである。ここでは,RIP-seqとCRACを用いたHAX1 RNA標的のトランスクリプトームワイド特性化を報告し,HAX1がリボソーム生合成とrRNAプロセシングに関与する転写物に結合することを示した。CRISPRノックアウトを用いて,HAX1のRNA標的がHAX1 KOでダウンレギュレートされた転写物と部分的に重複し,mRNA安定化における役割を示唆した。遺伝子オントロジー分析は,HAX1 KO(リボソーム生合成と翻訳に関与する遺伝子を含む)で差次的に発現する遺伝子が,4つの分析した新生物でHAX1発現と相関する遺伝子のサブセットに富んでいることを示した。リボソーム生合成に対する機能的連結も,勾配沈降リボソームプロファイルにより示され,HAX1 WT/KOにおける小サブユニット:モノソーム比の違いを明らかにした。HAX1発現の変化は,翻訳の調節不全を介してHAX1結合疾患の病因に重要であると推測した。【JST・京大機械翻訳】

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, , , 【Automatic Indexing@JST】

遺伝子発現

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