過渡水ワイヤは設計されたチャンネル蛋白質の選択的プロトン伝導を仲介する【JST・京大機械翻訳】

Kratochvil, H. T.; Watkins, L. C.; Mravic, M.; Somberg, N. H.; Thomaston, J. L.; Nicoludis, J. M.; Liu, L.; Hong, M.; Voth, G. A.; DeGrado, W.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202214208814944 整理番号：22P0319395

過渡水ワイヤは設計されたチャンネル蛋白質の選択的プロトン伝導を仲介する【JST・京大機械翻訳】

Transient Water Wires Mediate Selective Proton Conduction in Designed Channel Proteins

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発行年： 2022年12月28日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年12月28日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

蛋白質を介した哺乳類パラグラフ選択的プロトン輸送は,細胞におけるプロトン勾配の形成および利用に必須である。プロトンは,水分子と極性側鎖の水素結合”ワイヤ”に沿って行われ,それは,静的蛋白質構造から推定される伝導経路における乾燥無極性伸長によってしばしば中断される。プロトンは過渡的な水ワイヤを形成することによってそのような乾燥スポットを通して行われ,しばしば水ワイヤ中の過剰なプロトン自体の存在と高度に相関すると仮定した。この仮説を検証するために,分子動力学シミュレーションを用いて,フリッカリング水ワイヤを形成することができる無極性セグメントによって散在する安定な水ポケットを有する膜貫通チャネルを設計した。最小の設計したチャンネルはウイルスプロトンチャンネルと同様の速度でプロトンを伝導し,それらはNa ̄+よりもH ̄+に対して少なくとも106倍選択的であった。これらの研究は,陽子伝導材料工学のための生物学的プロトン伝導と原理の機構を知っている。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , 【Automatic Indexing@JST】

細胞膜の輸送

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