ナメクジウオと脊椎動物小規模遺伝子重複の平行進化【JST・京大機械翻訳】

Braso-Vives, M.; Marletaz, F.; Echchiki, A.; Mantica, F.; Acemel, R. D.; Gomez-Skarmeta, J. L.; Hartasanchez, D. A.; Targa, L. L.; Pontarotti, P.; Tena, J. J.; Maeso, I.; Escriva, H.; Irimia, M.; Robinson-Rechavi, M.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202214217073027 整理番号：22P0312626

ナメクジウオと脊椎動物小規模遺伝子重複の平行進化【JST・京大機械翻訳】

Parallel evolution of amphioxus and vertebrate small-scale gene duplications

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資料名：
発行年： 2022年09月25日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年09月25日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

【背景】Amphioxusは,遅い形態学的および分子進化を特徴とする非脊椎動物脊索動物である。それらは脊椎動物と基本的脊索体-計画とゲノム構成を共有するが,それらの2R全ゲノム重複と発生複雑性を欠いている。これらの理由で,ナメクジウオは脊椎動物ゲノム進化とEvo-Devoを研究するためのアウトグループとして頻繁に使用される。全ゲノム重複の他に,遺伝子はより小さなスケールで連続的に複製した。小スケール重複遺伝子は,ナメクジウオと脊椎動物ゲノムの両方で発見できるが,脊椎動物ゲノムのみが2R全ゲノム重複の重複遺伝子産物を持つ。ここでは,ナメクジウオ系統における小規模遺伝子重複の歴史を調べ,脊椎動物における小および大規模遺伝子重複史と比較した。【結果】著者らは,新しい高品質ゲノム参照によるヨーロッパナメクジウオ(Branchiostoma lanceolatum)遺伝子重複の研究を提示する。全体的な遅い分子進化にもかかわらず,ナメクジウオ系統は脊椎動物で観察されるものと類似の小規模重複の歴史を持つことを見出した。ナメクジウオと脊椎動物の間の平行遺伝子重複プロファイルと遺伝子重複における保存された機能的制約を見出した。さらに,ナメクジウオ遺伝子複製は脊椎動物重複遺伝子で観察されるものと類似の機能的特殊化の発現レベルとパターンを示す。著者らはまた,2つの主要な染色体再配列を有する2つの離れたナメクジウオ種,B.lanceolatumとB.floridaeの間の遺伝子シンテニーの強い保存を見出した。結論:それらのより遅い分子および形態学的進化とは対照的に,ナメクジウオの小規模遺伝子重複の歴史は,定量的および機能的観点の両方で脊椎動物系統のそれと類似している。【JST・京大機械翻訳】

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進化論一般

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