定量化のための ̄15N標識サンプルにおける平行反応モニタリングの応用【JST・京大機械翻訳】

Reyes, A. V.; Shrestha, R.; Baker, P. R.; Chalkley, R. J.; Xu, S.-L.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202214306938848 整理番号：22P0028631

定量化のための ̄15N標識サンプルにおける平行反応モニタリングの応用【JST・京大機械翻訳】

Application of Parallel Reaction Monitoring in 15N labeled Samples for Quantification

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発行年： 2022年04月11日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年04月11日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

正確な相対定量はプロテオーム研究で重要である。in vivoでの植物発現蛋白質への安定同位体 ̄15Nの取り込みは,分取および分析変動性を低減する主要な利点を有する正確な定量のための強力なツールである。しかし, ̄15N標識定量にはいくつかの挑戦がある。不完全な標識のため,重ラベル化サンプルでは同定がより少なく,逆標識実験での欠損値をもたらす。MS1調査スキャンにおける共溶出ペプチドまたは化学ノイズからの汚染があるとき,不正確定量が起こり得る。定量におけるこれらの欠点は,少ない豊富だが生物学的に興味深い蛋白質においてより顕著であり,それは,しばしば,非常に少ない同定ペプチドを有する。ここでは,高分解能,高質量精度Orbitrap質量分析計での ̄15N標識試料への並列反応モニタリング(PRM)の適用を示し,試料中の低存在量蛋白質でも信頼できる定量を達成した。【JST・京大機械翻訳】

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蛋白質・ペプチド一般

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