多重イメージング最適化と再現性解析のためのフレームワーク【JST・京大機械翻訳】

Eng, J. R.; Bucher, E.; Hu, Z.; Zheng, T.; Gibbs, S.; Chin, K.; Gray, J. W.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202214434154884 整理番号：22P0028232

多重イメージング最適化と再現性解析のためのフレームワーク【JST・京大機械翻訳】

A framework for multiplex imaging optimization and reproducible analysis

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発行年： 2022年05月05日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年05月05日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

多重イメージング技術は,組織の単一細胞表現型決定と空間特性化のためにますます使用されている。しかし,プラットフォーム,プロトコルおよび分析パイプラインの性能を比較するには,透明な方法が必要である。再現可能な画像処理のためのpythonソフトウェアを開発し,信号除去,抗体特異性,バックグラウンド補正,およびマルチプレックスイメージングのバッチ正規化を,サイクリック免疫蛍光法(CyCIF)の焦点で共有するために,Jupyterノートブックを利用した。本研究は,CyCIF方法論を改善し,容易に共有され再現できる多重画像分析のフレームワークを提供する。【JST・京大機械翻訳】

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, , , 【Automatic Indexing@JST】

医用画像処理 , 図形・画像処理一般

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