ゲノムワイド関連研究の力および偽陽性率に対する実験計画,遺伝的アーキテクチャおよび閾値の影響【JST・京大機械翻訳】

Loh, Z.; van der Werf, J. H. J.; Clark, S.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202214438440172 整理番号：22P0315876

ゲノムワイド関連研究の力および偽陽性率に対する実験計画,遺伝的アーキテクチャおよび閾値の影響【JST・京大機械翻訳】

Effects of Experimental Design, Genetic Architecture and Threshold on Power and False Positive Rate of Genome-Wide Association Studies

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発行年： 2022年02月22日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年02月22日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

ゲノム-Wide協会研究は形質に関連する遺伝的マーカーを同定するための重要なツールであるが,多重試験問題によって悩まされ,多重試験補正法を必要とする。多くの多重試験方法が提案されているが,例えば,BonferroniとBenjamini-Hochbergs False Discovery Rate,これらの方法に基づく調整閾値の品質は,同様に調査されていない。本研究の目的は,BonferroniとBenjamini-Hochbergs False Discovery Rate Multiplement Farse False Discovery S著者らの結果は,マーカーがBenjamini-Hochbergs False Discovery Rateからの閾値に依存しないとき,実験での電力と偽陽性率の間のより良いバランスを提供することを示唆する。しかし,マーカー間の相関により,Benjamini-Hochbergs False Discovery Rateの閾値は,過剰数の偽陽性で,あまりにもなる。サンプルサイズやマーカー数などの実験設計パラメータ,および形質の遺伝的構造は,電力と偽陽性率のバランスに影響する。この実験は,実験を行うとき,適切な実験計画と多重試験補正法の選択における指針を提供した。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , , , 【Automatic Indexing@JST】

遺伝学研究法 , 分子・遺伝情報処理

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