生命の木におけるDNA修飾の発生と量【JST・京大機械翻訳】

Varma, S. J.; Calvani, E.; Gruening, N.-M.; Messner, C. B.; Grayson, N.; Capuano, F.; Muelleder, M.; Ralser, M.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202214469682174 整理番号：22P0318893

生命の木におけるDNA修飾の発生と量【JST・京大機械翻訳】

Occurrence and quantities of DNA modifications across the tree of life

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発行年： 2022年03月24日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月24日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

メチルシトシン(5mdC),メチルアデニン(N6mdA),またはヒドロキシメチルシトシン(5hmdC)のような酵素的DNA修飾はクロマチン機能,遺伝子発現調節,抗ウイルス防御に重要であるが,非モデル生物では研究されていない。酵素DNA修飾の高感度かつ正確な定量のための質量分析法を確立し,85の細菌ゲノム,19の植物試料,12の動物種からの41の組織,6つの酵母種,および2つの古細菌種を分析した。酵母および昆虫におけるDNA修飾の非常に低い濃度しか報告されていないが,細菌およびより高い真核生物の両方に対して普遍的にDNA修飾を見出した。特に原核生物では,著者らのデータセットは,進化的関係と宿主-病原体相互作用,しかし,一般的に生態学的ニッチではなく,DNA修飾の類似程度を選択することを示した。より高い真核生物では,組織間の最大濃度差が5hmdCで検出された。著者らのデータセットは,さらにDNA修飾の研究において注意を正当化するユニークな生物学的事例を明らかにする。例えば,著者らのデータは,大部分の種がただ1つの優勢なDNA修飾を含むことを示す一方,著者らは,Raphanus sativusにおいて並列に存在するDNA修飾(5mdC,N6mdA,および5hmdC)のすべてを検出する。タマネギ,ヒマワリ,または草大青茎のような他の植物種は,メチル化されたシトシンの35%以上を持っている。最後に,脊椎動物の中枢神経系でこれまで研究された5hmdCは,Oman garra脳ですべてのシトシンの8%に達する濃度に達し,Lepidium sativumのようないくつかの植物でも検出された。本研究はDNA修飾を研究するための生物学的多様性の開発を強調する。【JST・京大機械翻訳】

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核酸一般

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