bZIP二量体に対する”ZIPコード”の発見は,シス要素進化の新規モチーフ,調節規則および1億年を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Li, M.; Lin, W.; Hinckley, W. E.; Yao, T.; Muchero, W.; Chen, J.; Huang, S.-s. C.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202214493587220 整理番号：22P0334751

bZIP二量体に対する”ZIPコード”の発見は,シス要素進化の新規モチーフ,調節規則および1億年を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Uncovering the "ZIP code" for bZIP dimers reveals novel motifs, regulatory rules and one billion years of cis-element evolution

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発行年： 2022年04月17日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年04月17日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

多くの真核生物転写因子(TF)は遺伝子発現を調節するホモ二量体またはヘテロ二量体複合体を形成する。例えば,塩基性ロイシンジッパー(bZIP)ファミリーの二量化特性は,すべての真核生物におけるユニークな生物学的機能の調節に重要な役割を果たす。しかし,ホモ-対ヘテロ二量体の結合配列と機能的特異性の根底にある分子機構は不明である。このギャップを埋めるために,内因性ゲノム状況におけるヘテロ二量体DNA結合部位をマップする二重DNA親和性精製配列(dDAP-seq)技術を開発した。Arabidopsisにおける20対のC/S1bZIPヘテロ二量体とS1ホモ二量体のゲノムワイド結合プロファイルは,ヘテロ二量体化がbZIP TFのDNA結合選択性を著しく拡大することを明らかにした。ストレス応答と発生におけるヘテロ二量体標的遺伝子の分析は,ヘテロ二量体化がホモ二量体とは異なる調節応答を引き起こすことを示唆する。植物bZIPにより認識された古典的ACGT要素に加えて,C/S1ヘテロ二量体は,1億年以上前に植物から分岐する酵母のGCN4シスエレメントと起源を共有するモチーフに結合することを見出した。重要なことに,ヘテロ二量体結合特異性は,GCN4関連モチーフに対するACGTモチーフに対するそれらの相対的優先性により識別できる。より広く,本研究は,コンビナトリアル遺伝子調節に重要な相互作用TFのDNA結合特異性を解読する際のdDAP-seqの可能性を実証した。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , 【Automatic Indexing@JST】

遺伝子発現

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