セナタキシンとE2プロモーター結合因子の転写標的はオートファジーフラックス増加時の神経変性経路と関連する【JST・京大機械翻訳】

Casey, A.; Liu, W.; Hein, L.; Sargeant, T.; Pederson, S. M.; Maekinen, V.-P.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202214621554934 整理番号：22P0330544

セナタキシンとE2プロモーター結合因子の転写標的はオートファジーフラックス増加時の神経変性経路と関連する【JST・京大機械翻訳】

Transcriptional targets of senataxin and E2 promoter binding factors are associated with neuro-degenerative pathways during increased autophagic flux

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発行年： 2022年04月07日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年04月07日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

オートファジーは有害な分子を分解する細胞内リサイクルプロセスであり,細胞オルガネラの最適組成を維持し,飢餓時の生存を可能にする。以前の研究は,転写因子(TF)が,治療可能性(老化脳におけるオートファジーの障害,特に,認知症の重要な危険因子であるかもしれない)でオートファジーをいかに増加できるかを実証してきた。システム展望からのオートファジーの転写調節を調べるために,HeLa,HEK293およびSH-SY5Y細胞におけるアミノ酸飢餓およびmTOR阻害によるオートファジーを誘導し,RNA-seqを用いて3時点で遺伝子発現を測定した。mTOR阻害による飢餓と284遺伝子(各細胞系におけるPFDR<0.05)による453の差次的発現(DE)遺伝子を観察した。経路分析は,Alzheimer(SH-SY5YおよびHeLaにおけるPFDR<0.001)およびParkinson病(PFDR[≦]0.024,SH-SY5YおよびHeLa)疾患および筋萎縮性側索硬化症(ALS,PFDR<0.05,6つの実験のうちの4つ)における遺伝子の濃縮を確認した。次に,シグナル伝達経路影響分析とTF標的濃縮試験を統合し,どのTF標的遺伝子が経路摂動に寄与しているかを予測した。Senataxin(SETX)標的遺伝子セットの差次的発現は,複数の神経変性経路(PFDR[≦]0.04)を活性化すると予測された。特に,SETXはALSのまれな型の原因遺伝子である。神経起源のSH-SY5Y細胞において,E2F転写ファミリーはAlzheimer病経路を活性化すると予測された(PFDR[≦]0.0065)。SETXとE2Fはオートファジーの転写調節の重要なメディエーターであり,神経変性条件に対する新しい治療機会を提供する。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , 【Automatic Indexing@JST】

細胞生理一般 , 遺伝子発現

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