マウスにおける条件付きPtenノックアウトニューロンの単一細胞RNA配列決定【JST・京大機械翻訳】

Svoboda, M.; Luikart, B. W.; Bosco, G.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202214642528194 整理番号：22P0318536

マウスにおける条件付きPtenノックアウトニューロンの単一細胞RNA配列決定【JST・京大機械翻訳】

Single-cell RNA sequencing of conditional Pten knockout neurons in mice

出版者サイト {{ this.onShowPLink() }} 複写サービスで全文入手
高度な検索・分析はJDreamⅢで

この文献はプレプリントです。プレプリントについてはこちらをご確認ください。

著者 (3件)： , ,
資料名：
発行年： 2022年05月26日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年05月26日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

PTENは,突然変異が自閉症スペクトラム障害(ASD)と強く関連する良く知られた腫瘍抑制因子である。ニューロンにおけるPTENの活性と機能は様々な設定で広く研究されているが,動物モデルはin vivoでのニューロン発生におけるPTENの役割を実験的に修飾し試験するための最良の機会を提供する。分子レベルでは,mTOR経路抑制におけるPTENの重要性はよく知られているが,他の多くの相互作用が示唆され,他は未発見のままである。したがって,遺伝的レベルでPTENの下流調節景観を組織的に探索するために,in vivoでPten遺伝子をノックアウトする結果として遺伝子発現変化を測定するために単一細胞RNA配列決定(scRNA-seq)ワークフローを確立した。4つの条件的にノックアウトしたマウス試料から脳組織を収集でき,それらを単一生細胞に解離させ,続いてフローソートし,scRNA-seqライブラリーを調製した。これらのステップの全ては,単一日で完了し,細胞クラスタ化,細胞型同定,および差次的発現測定に適した数百の細胞からの配列データを得た。実現可能性を示したので,このアプローチは,調節ネットワークが完全に定義されていない他の遺伝子と同様にPtenの機能のマッピングにおける仮説生成と発見を助けることを期待する。【JST・京大機械翻訳】

, , , , , , , , , , ,
, , , , , 【Automatic Indexing@JST】

遺伝子発現 , 腫ようの化学・生化学・病理学

, , , , ,

前のページに戻る