低GCバイアスによる新しいゲノムDNAライブラリー調製法【JST・京大機械翻訳】

Kelly, T.; Haokoyama, T.; Kumaishi, K.; Yabukami, H.; Kato, S.; Hayashi, M.; Minoda, A.; Ichihashi, Y.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202214679060672 整理番号：22P0313750

低GCバイアスによる新しいゲノムDNAライブラリー調製法【JST・京大機械翻訳】

A novel genomic DNA library preparation method with low GC bias

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発行年： 2022年01月29日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月29日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

次世代シークエンシング(NGS)ライブラリーを調製するために利用可能な入力DNAの量は,しばしば制限され,GC含量バイアスと現在利用可能なプロトコルによる特異的ゲノム領域の濃縮につながる。本研究では,ゲノムDNAライブラリーの調製のための新しい費用対効果の高いプロトコルを開発するために,DNAに配列アダプタを組込むために呼気捕獲技術を使用した。1~50ngの範囲の入力DNA量を有するゲノムDNAライブラリー調製のための一般的市販キットと著者らのプロトコルを比較するベンチマーク実験を行った。本プロトコルは,標準プロトコルとは対照的に,被覆幅と低GCバイアスの著しい改善で高品質ゲノム配列データを生成することができる。さらに,著者らのプロトコルは,試料処理時間と試薬コストを低減し,他のプロトコルと比較して比較的少ない酵素段階を必要とし,ゲノム応用の範囲に適している。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , , 【Automatic Indexing@JST】

遺伝学研究法 , 遺伝子の構造と化学

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