膣マイクロバイオームは子宮内膜癌グレードおよび組織学と関連する【JST・京大機械翻訳】

Hakimjavadi, H.; George, S. H.; Taub, M.; Dodds, L.; Sanchez-Covarrubias, A. P.; Huang, M.; Pearson, M.; Slomovitz, B. M.; Kobetz, E.; Gharaibeh, R. Z.; Sowamber, R.; Pinto, A.; Chamala, S.; Schlumbrecht, M.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202214892215566 整理番号：22P0320110

膣マイクロバイオームは子宮内膜癌グレードおよび組織学と関連する【JST・京大機械翻訳】

Vaginal microbiome is associated with endometrial cancer grade and histology

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発行年： 2022年02月01日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年02月01日
JST資料番号： O7002B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

【背景】膣ミクロビオームは,子宮内膜癌(EC)の病態生理に関する洞察をもたらし,疾患の早期マーカーとして役立つ可能性がある未開発環境である。目的は,良性疾患をECから分離できるパターンを同定し,ECから良性疾患を分離できるパターンを同定し,高グレード(HG)組織から低グレード(LG)を区別するかどうかを評価するため,女性における術前膣ミクロビオームを評価することであった。【方法】膣ミクロビオームサンプルを,子宮摘出時に前向きに収集し,臨床病理学的データを集めた。抽出したDNAはショットガンメタゲノム配列決定を受けた。微生物多様性をShannon指数(多様性)とPERMANOVA({ベータ}多様性)を用いて計算した。階層的クラスタリングを用いてコミュニティ状態タイプ(CST)を記述し,次に微生物多様性とグレードを比較した。機械学習を用いて相対細菌豊度に基づくグレードと組織学の予測値を評価した。【結果】61人の患者が参加した。1)良性婦人科疾患(n=11),2)LG EC(n=30),3)HG EC(n=20)。40例(62.5%)は白,22例(34.3%)は黒,37例(57.8%)はヒスパニックであった。-および{β}-多様性は,それぞれ腫瘍グレード(p{2乗}={2乗}0.026およびp{2乗}={2乗}0.035)と関連していた。4つのCSTは,疾患グレード(p=0.036)と関連すると同定された。異なる組織学は,腫瘍グレード(p=0.017)内でもCSTの変化を示した。種レベルでのマーカーは,良性対癌(AUC0.878),HG対良性(AUC=0.803),HG対LG(AUC=0.771)を高い精度で予測した。結論:膣ミクロビオームは,ECから良性疾患を分離し,組織学とグレードの予測であり,スクリーニングのための有効なツールである可能性があることを示唆する。【JST・京大機械翻訳】

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女性生殖器と胎児の腫よう

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