不偏性メタトランスクリプトーム解析を使用したスロートスワブからの病原体検出と特性化【JST・京大機械翻訳】

Toma, R.; Duval, N.; Shen, N.; Torres, P.; Camacho, F.; Chen, J.; Ogundijo, O.; Banavar, G. S.; Vuyisich, M.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202214945924181 整理番号：22P0334918

不偏性メタトランスクリプトーム解析を使用したスロートスワブからの病原体検出と特性化【JST・京大機械翻訳】

Pathogen detection and characterization from throat swabs using unbiased metatranscriptomic analyses

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発行年： 2022年04月16日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年04月16日
JST資料番号： O7002B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

【目的】感染症は一般的であるが,現在の方法論によって容易にまたは容易に診断されない。この問題は,変異,新生および新規病原体の一定の存在によりさらに悪化する。多くの病原体による感染の最も一般的な部位の一つは,ヒトスロートである。しかし,これらの病原体を区別することができる普遍的な診断試験はない。スロートのトランスクリプトーム(MT)分析は,完全に不偏なアプローチで全ての病原体を同定することができるので,感染症検出と特性化における重要で新しい開発を示す。病原体検出に対するMTアプローチの有用性をテストするため,急性病気の前,中,後の参加者からスロート試料を収集した。【結果】病原性微生物における明白な病気関連シフトを,微生物機能および抗菌耐性遺伝子への重要な洞察とともに,参加者において検出した。【結論】スロートのMT分析は,病原体の不偏同定と特性化のための効果的方法である。MTデータは試料中のすべての微生物を含むので,この方法は病原体の同定だけでなく,ヒト健康と疾患との関連における常在性スロートミクロビオームの影響の理解を可能にする。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , , , 【Automatic Indexing@JST】

感染症・寄生虫症一般

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