MHC-II結合のためのプロファイル病原体プロテオームへのハイスループット酵母ディスプレイアプローチ【JST・京大機械翻訳】

Huisman, B. D.; Dai, Z.; Gifford, D. K.; Birnbaum, M. E.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202215062742713 整理番号：22P0316041

MHC-II結合のためのプロファイル病原体プロテオームへのハイスループット酵母ディスプレイアプローチ【JST・京大機械翻訳】

A high-throughput yeast display approach to profile pathogen proteomes for MHC-II binding

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発行年： 2022年03月11日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月11日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

T細胞は適応免疫応答において重要な役割をし,Major組織適合性複合体(MHC)蛋白質により細胞表面に存在するペプチド抗原を認識する。MHC結合に対するペプチドの評価は,これらの相互作用を調べる重要な成分であるが,MHC結合に対する興味あるペプチド試験のための従来のアッセイは,スループットに限定されている。ここでは,ハイスループット様式で数十万のユーザ定義ペプチドの結合を評価するための酵母ディスプレイに基づくプラットフォームを示した。このアプローチを適用して,HLA-DR401,-DR402および-DR404を含むヒトクラスII MHCに結合するためのSARS-CoV-2プロテオームおよび4デングウイルス血清型をカバーするタイルライブラリーを評価した。このアプローチは,計算予測によって見逃される結合材料を同定し,最先端の訓練データを与える系統的計算誤差の可能性を強調し,エピトープ同定実験のための設計上の考慮事項を強調した。このプラットフォームは,ウイルス保存とMHC結合の間の関係を調べるためのフレームワークとして機能し,ウイルス蛋白質から潜在的に高いペプチド結合体の同定に使用できる。これらの結果は,高信頼ペプチド-MHC結合を決定するためのこのアプローチの有用性を実証した。【JST・京大機械翻訳】

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, , 【Automatic Indexing@JST】

免疫反応一般 , 生物科学研究法一般 , 生物学的機能 , 免疫性疾患・アレルギー性疾患一般 , 生体防御と免疫系研究法

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