イオンチャンネル有限要素計算のための膜および溶媒四面体メッシュの効率的生成【JST・京大機械翻訳】

Chao Zhen; Gui Sheng; Lu Benzhuo; Xie Dexuan

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202215240251540 整理番号：22P0274867

イオンチャンネル有限要素計算のための膜および溶媒四面体メッシュの効率的生成【JST・京大機械翻訳】

Efficient Generation of Membrane and Solvent Tetrahedral Meshes for Ion Channel Finite Element Calculation

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発行年： 2022年01月14日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月14日
JST資料番号： O7000B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

Poisson-Boltzmann方程式(PBE)およびPoisson-Nernst-Planck方程式(PNP)の系のようなイオンチャネル誘電体連続体モデルの有限要素解は,イオンチャネル蛋白質領域,膜領域,およびイオン溶媒領域に対して四面体メッシュを必要とし,また,界面はシミュレーションボックスドメインの不規則な四面体メッシュに適合した。しかしながら,これらのメッシュを生成することは,非常に複雑な幾何学的形状を有する関連する3つの領域のために,非常に難しく,非常に技術的である。現在,Luの研究グループで開発されたイオンチャネルメッシュ生成ソフトウェアパッケージは,公共ドメインで利用できる。メッシュ品質とコンピュータ性能を著しく改善するために,本論文では,膜および溶媒メッシュを生成するための新しい数値スキームを提示し,Pythonに実装し,新しいイオンチャネルメッシュ生成ソフトウェアパッケージを得た。次に,数値結果を,異なる幾何学的複雑性を持つイオンチャネル細孔を有するイオンチャネル蛋白質のための新しいパッケージにより生成されたメッシュの品質と新しい数値スキームの効率を実証するために報告した。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , 【Automatic Indexing@JST】

高分子固体の物理的性質 , その他のオペレーションズリサーチの手法

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