実験的な再現性は,腫瘍プロテオミクスプロファイルにおけるmRNAと蛋白質存在量間の相関を制限する【JST・京大機械翻訳】

Upadhya, S. R.; Ryan, C.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202215634244531 整理番号：21P0267340

実験的な再現性は,腫瘍プロテオミクスプロファイルにおけるmRNAと蛋白質存在量間の相関を制限する【JST・京大機械翻訳】

Experimental reproducibility limits the correlation between mRNA and protein abundances in tumour proteomic profiles

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発行年： 2022年02月17日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年02月17日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

ヒトプロテオームの大規模研究は,mRNAと蛋白質量の間の中程度の相関のみを明らかにした。この中程度の相関が転写後調節をどのように反映するか,またどの程度が測定誤差を反映するかは不明である。ここでは,腫瘍と細胞系の複製プロファイルを解析することにより,個々の遺伝子からの転写物と蛋白質の測定の再現性に相当な変化があることを示した。より再現性のある測定を有する蛋白質は,より高いmRNA-蛋白質相関を持つ傾向があり,測定再現性がmRNAと蛋白質存在量の間の説明不能な変動の実質的な割合を占めることを示唆した。個々の蛋白質の再現性は,研究を通していくらか一致しており,これを利用して,複数の研究にわたるmRNA-蛋白質相関における相当な量の変異を説明する凝集再現性スコアを開発した。最後に,以前に高い平均mRNA-蛋白質相関を有することが報告されている経路は,より再現性良く定量できるメンバーを含むことを示した。【JST・京大機械翻訳】

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, , , 【Automatic Indexing@JST】

遺伝子発現 , 微生物の生化学

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