空間パターンと共局在化のスケーラブルでモデルフリーな検出【JST・京大機械翻訳】

Liu, Q.; Hsu, C.-Y.; Shyr, Y.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202215691252427 整理番号：22P0338823

空間パターンと共局在化のスケーラブルでモデルフリーな検出【JST・京大機械翻訳】

Scalable and model-free detection of spatial patterns and colocalization

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発行年： 2022年04月21日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年04月21日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

空間オミクス技術における迅速な成長は,分子および単一細胞解像度でのゲノム全体の分子事象のプロファイリングを可能にし,空間パターンを特徴づけるための迅速で信頼性のある方法の必要性を強調する。大規模空間オミクス研究において任意の空間パターンを迅速に発見するためのモデルフリー法であるSpaGeneを開発した。シミュレーションと多様な空間分解トランスクリプトミクスデータは,SpaGenが既存の方法より強力でスケーラブルであることを示した。SpaGeneによる空間発現パターンは非観察組織構造を再構築した。SpaGeneはまた,それらの共局在を介してリガンド-受容体相互作用を成功裏に発見した。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , , , 【Automatic Indexing@JST】

遺伝子発現 , 分子・遺伝情報処理

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