複製関連逆位は細菌染色体構造変化の優性型である【JST・京大機械翻訳】

D'Iorio, M.; Dewar, K.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202215720566517 整理番号：22P0315453

複製関連逆位は細菌染色体構造変化の優性型である【JST・京大機械翻訳】

Replication-associated inversions are the dominant form of bacterial chromosome structural variation

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発行年： 2022年02月15日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年02月15日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

細菌染色体の構造配列は近縁種間で広く変化し,有意な表現型結果をもたらす。dnaA遺伝子に対して対称である大規模染色体反転の出現(通常,oriC,複製の起源)が以前に観察された;しかし,細菌における複製関連構造再配列(RASRs)の全体的な罹患率とそれらの原因機構は現在知られていない。完全長ゲノム配列決定の減少した費用は,複数の異なるクレードにわたる完全なゲノムの急速に成長する収集をもたらし,従って,多様な系統発生分類を網羅する種の状況における染色体反転を調べる機会を可能にした。ここでは,RefseqとGenbank NCBIデータベースを用いて多重完全配列ゲノムを持つ種における大きな染色体反転の位置を系統的に同定し,生物学的機構を仲介する可能性を調べた。10またはそれ以上の完全なゲノムで利用可能な239種のうち,206は,種内配列比較のセットにおいて少なくとも1つの大きな([≧50Kb)反転を有する配列を含んでいた。127,161の大きな反転の73.4%が注釈dnaA遺伝子への10%の比例距離の点に集中し,これはしばしば複製の起源に近い。注釈dnaA配列からの反転オフセットは,一般的に複製の実際の起源に集中していることが確認された。複製起源と隣接反復の有病率からの等分性ブレークポイントは,複製過程中に形成される切断が,反対の位置に修復されるという証拠を提供する。また,複製の後期段階と対称性からの距離の変化の間の強い関係を見出し,複製フォーク停止がいくつかの反転における非対称性の機構的原因であるかもしれないことを示唆した。【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子の構造と化学

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