プレプリント
J-GLOBAL ID:202202215924102404   整理番号:22P0334547

ヒトColon内臓平滑筋細胞,PDGFRα細胞の単一核配列決定とCajalの間質細胞【JST・京大機械翻訳】

Single Nucleus Sequencing of Human Colon Visceral Smooth Muscle Cells, PDGFRα Cells, and Interstitial Cells of Cajal
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発行年: 2022年04月14日  プレプリントサーバーでの情報更新日: 2022年04月14日
JST資料番号: O7001B  資料種別: プレプリント
記事区分: プレプリント  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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【背景と目的】筋細胞(SMCs),Cajal(ICCs)の間質細胞,およびPDGFR+細胞(PC)は,SIPシンシチウムとして知られる腸において機能的シンシチウムを形成する。SIPシンシチウムは腸の運動性を調整するため腸神経系(ENS)と協調して作用する。しかし,このシンシチウムを形成する個々の細胞型の理解と,それらが互いにどのように相互作用するかは,ヒトSIPシンシチウム細胞に焦点を当てた以前の単一細胞RNAeq解析なしに,限られたままである。【方法】著者らは,15の個体に由来する10,749人のヒト結腸SIPシンシチウム細胞(5572SMC,372ICC,および4805PC核)からの単一核RNA配列データを分析した。【結果】臨界収縮およびペースメーカー機能および既知のENS相互作用と一致して,SIPシンシチウム細胞タイプは,ICCおよびPCにおいて機械感受性チャンネルを含む多くのイオンチャンネルを発現する。PCはまた,血管活性腸ペプチド(VIPR2)に対するECM関連遺伝子と抑制性神経伝達物質受容体を著明に発現させ,新しい知見である。多くのイオンチャンネルと転写調節因子の発現が異なる2つのPCクラスターを同定した。興味深いことに,SIPシンシチウム細胞は6つの転写因子(FOS,MEIS1,MEIS2,PBX1,SCMH1,およびZBTB16)を共発現し,これらの細胞を指定するコンビナトリアル署名の一部である可能性がある。SIPシンシチウム遺伝子発現におけるBowel領域特異的差異は,左(シグモイド)結腸におけるSMCおよびPCより,より転写制御因子およびイオンチャンネルを発現する,右(上昇)結腸SMCおよびPCと,機能における地域差と相関する可能性がある。【結語】これらの研究は,腸運動障害を理解して,強調された遺伝子と経路の将来調査につながる可能性があるSIPシンシチウム生物学への新しい洞察を提供する。ヒトSIPシンシチウムのこの最初の単一核RNASeq分析である,2種類のPDGFR+細胞,SIP特異的コンビナトリアル転写因子シグネチャ,および遺伝子発現における結腸領域差を含むSIPシンシチウム細胞の新しい特徴を同定した。【JST・京大機械翻訳】
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分類 (2件):
分類
JSTが定めた文献の分類名称とコードです
細胞生理一般  ,  消化器の基礎医学 

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