プレプリント
J-GLOBAL ID:202202216020713361   整理番号:21P0241790

膜接触確率:膜蛋白質の構造的および機能的研究のための必須および予測特性【JST・京大機械翻訳】

Membrane contact probability: an essential and predictive character for the structural and functional studies of membrane proteins
著者 (4件):
資料名:
発行年: 2022年01月30日  プレプリントサーバーでの情報更新日: 2022年01月30日
JST資料番号: O7001B  資料種別: プレプリント
記事区分: プレプリント  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
抄録/ポイント:
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膜蛋白質のユニークな形質の1つは,それらの疎水性アミノ酸のかなりの画分が蛋白質内部に埋め込まれたよりも脂質二分子層の疎水性コアに曝露され,それは蛋白質構造と機能予測においてしばしば考慮されないことである。ここでは,脂質分子のアシル鎖と直接接触する,与えられた配列のアミノ酸の尤度を記述する,膜接触確率(MCP)の特性と予測量を提案した。MCPは膜蛋白質の外表面の特性化において溶媒接近性に相補的であり,既知構造を有する膜蛋白質の分子力学シミュレーションから生成したデータベースであるMemProtMDから抽出した訓練データセットを利用して,機械学習に基づく方法で任意の配列に対して予測できることを示した。多くの潜在的応用の第一として,MCPが蛋白質接触マップと構造の予測精度を系統的に改善するために使用できることを示した。【JST・京大機械翻訳】
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, 【Automatic Indexing@JST】
分類 (2件):
分類
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蛋白質・ペプチド一般  ,  生体膜一般 
タイトルに関連する用語 (4件):
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