新しいコアゲノム多遺伝子座配列タイピング法を用いて確認されたフランスにおけるYersinia pseudotuberculosisクローン発生の最初の記述【JST・京大機械翻訳】

Savin, C.; Le Guern, A.-S.; Chereau, F.; Guglielmini, J.; Heuze, G.; Demeure, C.; Pizarro-Cerda, J.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202216119587805 整理番号：22P0319075

新しいコアゲノム多遺伝子座配列タイピング法を用いて確認されたフランスにおけるYersinia pseudotuberculosisクローン発生の最初の記述【JST・京大機械翻訳】

First description of a Yersinia pseudotuberculosis clonal outbreak in France, confirmed using a new core genome multilocus sequence typing method

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発行年： 2022年03月28日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月28日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

Yersinia pseudotuberculosisは,高齢患者において腸間膜無炎および敗血症を引き起こす軽度の腸炎を引き起こす腸内病原体である。大部分の症例は散発的であるが,発生は既に異なる国で記述されている。2020年に起こったフランスにおけるY.pseudotuberculosisクローン発生を初めて報告した。疫学的研究は,汚染のありそうな汚染源としてのトマトの消費を指摘した。Yersinia National Reference Laboratory(YNRL)は,発生に関連した分離株のクラスタ化を同定し,リアルタイムで分子タイピングを行うことができるY.pseudotuberculosisに特異的な1,921遺伝子を有する新しいcgMLSTスキームを開発した。さらに,この方法は2020年にこのクラスタに属する分離株を後向きに同定できた。特定の生物情報学スキルを必要としないこの方法は,現在YNRLで系統的に使用され,優れた識別力を示し,科学界に利用可能である。【JST・京大機械翻訳】

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微生物検査法 , 遺伝子操作 , 感染症・寄生虫症の診断

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